Nad królestwem Teb zbierają się czarne chmury. Ślepy, stary król Edyp opuścił tron w niesławie i poprosił swoich synów, Polinejkesa i Eteoklesa, aby wspólnie rządzili miastem. Jednak władza deprawuje, a dawne waśnie domagają się przelania nowej krwi. Wkrótce Polinejkes staje na czele armii rywalizującego miasta Argos, by stanąć do walki przeciwko własnemu bratu. Szlachta tebańska wspiera Eteoklesa, który z trudem utrzymuje władzę nad Tebami. Młody król wzywa obrońców, by obsadzili siedem bram miasta, podczas gdy siedmiu bohaterów najeźdźców prowadzi atak. Tymczasem słynna cytadela Teb, Kadmeja, pogrążona jest w chaosie. Wygląda na to, że same losy sprzeciwiły się obecnym władcom Teb!
Podczas gdy zwykli mieszkańcy szykują się do wojny, arystokratyczne rody szepczą między sobą, że nadszedł czas na nowe przywództwo i odbudowę Kadmei.
W grze Thebai gracze wcielają się w role wpływowych przywódców szlacheckich rodów w burzliwym okresie późnej epoki brązu. W trakcie rozgrywki będą odbudowywać Kadmeję, cytadelę Teb, przywracać miastu eksport, modlić się do lokalnych bóstw oraz chronić życie mieszkańców, podczas gdy wielcy bohaterowie przelewają krew u bram miasta.
Gra trwa 10 rund, z których każda składa się z fazy akcji oraz fazy losowej. W fazie akcji gracze wykorzystują jedną kostkę obywatela, po czym przemieszczają swojego archonta na obszar Kadmei. W fazie losowej gracze mogą zdobyć dodatkowe punkty w zależności od swoich osiągnięć oraz skuteczności w ochronie bram miasta. Po zakończeniu ostatniej rundy następuje ostateczne podliczenie punktów. Gracz z największą liczbą punktów zwycięstwa zostaje zwycięzcą rozgrywki.