W Moon Bunny wcielacie się w króliczych mistrzów alchemii inspirowanych azjatyckim folklorem. Waszym zadaniem jest wysyłanie króliczych pomocników na wyprawy po księżycowym krajobrazie w poszukiwaniu rzadkich ziół, z których przygotujecie legendarny eliksir życia.
Każdy z królików porusza się według własnego schematu skoków, dlatego musicie odpowiednio wybierać pomocników w zależności od tego, do jakiego miejsca chcecie dotrzeć. W swojej turze przemieszczacie królika, a następnie zabieracie do warsztatu zioło lub recepturę, na której zakończył swój ruch.
Zebrane składniki umieszczacie na swojej planszy warsztatu, próbując układać je w odpowiednie wzory. Punkty zdobywacie za realizowanie zarówno publicznych, jak i prywatnych receptur, dlatego ważne jest odpowiednie planowanie kolejnych ruchów i rozmieszczenia ziół.
Gra toczy się w rundach, podczas których każdy gracz wykonuje jedną turę. Koniec rozgrywki zostaje uruchomiony, gdy worek ze składnikami lub stos receptur się wyczerpie. Gracze kończą wtedy aktualną rundę, rozgrywają jeszcze jedną pełną rundę, a następnie podliczają punkty.
Zwycięża króliczy alchemik, który zgromadzi najwięcej punktów, tworząc najdoskonalsze receptury i przybliżając się do przygotowania eliksiru życia.