Manhattan Project: Energy Empire zawiera całą rozgrywkę z podstawowej edycji gry, a także dodatek „Cold War”, nowy dodatek „UN Envoys” oraz dodatkową zawartość.
Z popiołów wojny narody powstają, aby walczyć o wpływy w erze atomowej! W Manhattan Project: Energy Empire każdy gracz przejmuje kontrolę nad państwem rywalizującym o potęgę w drugiej połowie XX wieku. Rozwijaj przemysł, handel i administrację swojego kraju, zdobywając zasoby, budując nowe struktury i korzystając z różnych źródeł energii.
Największym zagrożeniem w Energy Empire nie jest wojna, lecz nieprzewidywalne skutki globalne wynikające z rozwoju przemysłu i zanieczyszczenia środowiska. Wiele działań wiąże się z pewnymi kosztami, im bardziej rozwija się gospodarka państwa, tym większy wpływ wywiera ono na środowisko. Odpowiednie wykorzystanie nauki pozwala ograniczać negatywne skutki przemysłu, a także pomagać w zapobieganiu globalnym kryzysom.
Energy Empire łączy mechaniki worker placement, budowania tableau oraz zarządzania zasobami. W swojej turze gracz może zdecydować, czy chce działać, czy generować energię. Podczas akcji działania umieszcza jednego robotnika na głównej planszy, a następnie wykorzystuje robotników i energię do aktywowania kart w swoim tableau. Gracze mogą również wydawać energię, aby skorzystać z zajętych pól na planszy głównej, dzięki czemu żadne miejsce nie zostaje całkowicie zablokowane.